MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 24023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015978	AGG	2	6	364	369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347533754
2	NC_015978	TGAA	2	8	381	388	50 %	25 %	25 %	0 %	347533754
3	NC_015978	ACA	2	6	441	446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533754
4	NC_015978	TTGGA	2	10	460	469	20 %	40 %	40 %	0 %	347533754
5	NC_015978	ATG	2	6	489	494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533754
6	NC_015978	CTAC	2	8	515	522	25 %	25 %	0 %	50 %	347533754
7	NC_015978	ATT	2	6	537	542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533754
8	NC_015978	AAC	2	6	549	554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533754
9	NC_015978	TGC	3	9	775	783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533754
10	NC_015978	GCT	2	6	893	898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533754
11	NC_015978	TTGA	2	8	1019	1026	25 %	50 %	25 %	0 %	347533754
12	NC_015978	AAG	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533754
13	NC_015978	TTC	2	6	1070	1075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533754
14	NC_015978	ACA	2	6	1101	1106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533754
15	NC_015978	CTG	2	6	1122	1127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533754
16	NC_015978	AATT	2	8	1144	1151	50 %	50 %	0 %	0 %	347533754
17	NC_015978	CAT	2	6	1282	1287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533754
18	NC_015978	A	6	6	1514	1519	100 %	0 %	0 %	0 %	347533754
19	NC_015978	TTG	2	6	1533	1538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533754
20	NC_015978	TGG	2	6	1612	1617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533754
21	NC_015978	AAC	2	6	1669	1674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533754
22	NC_015978	A	6	6	1708	1713	100 %	0 %	0 %	0 %	347533754
23	NC_015978	A	6	6	1937	1942	100 %	0 %	0 %	0 %	347533755
24	NC_015978	TCAA	2	8	1951	1958	50 %	25 %	0 %	25 %	347533755
25	NC_015978	TTCA	2	8	1965	1972	25 %	50 %	0 %	25 %	347533755
26	NC_015978	TCT	2	6	2005	2010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533755
27	NC_015978	AAC	2	6	2013	2018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533755
28	NC_015978	ACA	2	6	2060	2065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533755
29	NC_015978	TTCAA	2	10	2094	2103	40 %	40 %	0 %	20 %	347533755
30	NC_015978	GTG	2	6	2114	2119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533755
31	NC_015978	T	6	6	2178	2183	0 %	100 %	0 %	0 %	347533755
32	NC_015978	A	7	7	2196	2202	100 %	0 %	0 %	0 %	347533755
33	NC_015978	AGTT	2	8	2216	2223	25 %	50 %	25 %	0 %	347533755
34	NC_015978	CTG	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533755
35	NC_015978	AAG	2	6	2366	2371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533755
36	NC_015978	GTC	2	6	2411	2416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533755
37	NC_015978	ATT	2	6	2457	2462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533755
38	NC_015978	CTG	2	6	2513	2518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533755
39	NC_015978	AGC	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533755
40	NC_015978	TTG	2	6	2776	2781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533755
41	NC_015978	AAT	2	6	2797	2802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533755
42	NC_015978	AATTA	2	10	2805	2814	60 %	40 %	0 %	0 %	347533755
43	NC_015978	AGT	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533755
44	NC_015978	GAA	2	6	2878	2883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533755
45	NC_015978	CCAA	2	8	2889	2896	50 %	0 %	0 %	50 %	347533755
46	NC_015978	AAG	2	6	2948	2953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533755
47	NC_015978	AAG	2	6	3262	3267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533756
48	NC_015978	TGG	2	6	3332	3337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533756
49	NC_015978	GCAA	2	8	3338	3345	50 %	0 %	25 %	25 %	347533756
50	NC_015978	A	6	6	3361	3366	100 %	0 %	0 %	0 %	347533756
51	NC_015978	ATG	2	6	3379	3384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533756
52	NC_015978	TCG	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533756
53	NC_015978	A	6	6	3404	3409	100 %	0 %	0 %	0 %	347533756
54	NC_015978	GAT	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533757
55	NC_015978	AGC	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533757
56	NC_015978	AG	3	6	3756	3761	50 %	0 %	50 %	0 %	347533757
57	NC_015978	GAC	2	6	3873	3878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533757
58	NC_015978	TAA	2	6	3910	3915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533757
59	NC_015978	CGG	2	6	3941	3946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347533757
60	NC_015978	AAC	2	6	3954	3959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533757
61	NC_015978	ATTT	2	8	4007	4014	25 %	75 %	0 %	0 %	347533757
62	NC_015978	AGC	2	6	4036	4041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533757
63	NC_015978	CGC	2	6	4045	4050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347533757
64	NC_015978	CAA	2	6	4127	4132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533757
65	NC_015978	AT	3	6	4153	4158	50 %	50 %	0 %	0 %	347533757
66	NC_015978	A	7	7	4168	4174	100 %	0 %	0 %	0 %	347533757
67	NC_015978	GAAA	2	8	4240	4247	75 %	0 %	25 %	0 %	347533757
68	NC_015978	GAT	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533757
69	NC_015978	ACA	2	6	4339	4344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533757
70	NC_015978	AGA	2	6	4393	4398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533757
71	NC_015978	GAT	2	6	4427	4432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533757
72	NC_015978	TGA	2	6	4447	4452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533757
73	NC_015978	GAC	2	6	4455	4460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533757
74	NC_015978	AATT	2	8	4539	4546	50 %	50 %	0 %	0 %	347533757
75	NC_015978	AAGT	2	8	4589	4596	50 %	25 %	25 %	0 %	347533757
76	NC_015978	GACA	2	8	4617	4624	50 %	0 %	25 %	25 %	347533758
77	NC_015978	ATG	2	6	4661	4666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533758
78	NC_015978	TTG	2	6	4772	4777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533758
79	NC_015978	TGA	2	6	4788	4793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533758
80	NC_015978	TGT	2	6	4824	4829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533758
81	NC_015978	ACA	2	6	4841	4846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533758
82	NC_015978	TTC	2	6	4934	4939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533758
83	NC_015978	GGA	2	6	4945	4950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347533758
84	NC_015978	CGG	2	6	4956	4961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347533758
85	NC_015978	TGG	2	6	4962	4967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533758
86	NC_015978	TGG	2	6	4980	4985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533758
87	NC_015978	GTT	2	6	5008	5013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533758
88	NC_015978	AGT	2	6	5109	5114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533758
89	NC_015978	GAT	2	6	5131	5136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533758
90	NC_015978	T	6	6	5154	5159	0 %	100 %	0 %	0 %	347533758
91	NC_015978	CCAGAT	2	12	5161	5172	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347533758
92	NC_015978	GAC	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533758
93	NC_015978	CTT	2	6	5301	5306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533758
94	NC_015978	CAA	2	6	5466	5471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533758
95	NC_015978	AC	3	6	5494	5499	50 %	0 %	0 %	50 %	347533758
96	NC_015978	GAA	2	6	5500	5505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533758
97	NC_015978	ACA	2	6	5552	5557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533758
98	NC_015978	ATT	2	6	5560	5565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533758
99	NC_015978	CGG	2	6	5615	5620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347533758
100	NC_015978	GCT	3	9	5803	5811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533758
101	NC_015978	GAA	2	6	5835	5840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533758
102	NC_015978	TAA	2	6	5856	5861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533758
103	NC_015978	TAA	2	6	5880	5885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533758
104	NC_015978	ATT	2	6	5913	5918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533758
105	NC_015978	GAA	2	6	6049	6054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533758
106	NC_015978	GAA	2	6	6094	6099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533758
107	NC_015978	TAT	2	6	6179	6184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533758
108	NC_015978	ACC	2	6	6246	6251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533758
109	NC_015978	AAAT	2	8	6273	6280	75 %	25 %	0 %	0 %	347533758
110	NC_015978	GAA	2	6	6304	6309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533758
111	NC_015978	TAC	2	6	6405	6410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533758
112	NC_015978	CGT	2	6	6427	6432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533758
113	NC_015978	ATA	2	6	6452	6457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533758
114	NC_015978	TGA	2	6	6459	6464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533758
115	NC_015978	CGT	2	6	6511	6516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533758
116	NC_015978	A	7	7	6663	6669	100 %	0 %	0 %	0 %	347533759
117	NC_015978	TTG	2	6	6706	6711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533759
118	NC_015978	CGA	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533759
119	NC_015978	TATGG	2	10	6768	6777	20 %	40 %	40 %	0 %	347533759
120	NC_015978	A	6	6	6810	6815	100 %	0 %	0 %	0 %	347533759
121	NC_015978	ATC	2	6	6850	6855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533759
122	NC_015978	TGC	3	9	6968	6976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533759
123	NC_015978	ATG	2	6	7066	7071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
124	NC_015978	TGA	2	6	7210	7215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
125	NC_015978	TTC	2	6	7252	7257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533759
126	NC_015978	TGG	2	6	7277	7282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533759
127	NC_015978	GAA	2	6	7365	7370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533759
128	NC_015978	AAAC	2	8	7383	7390	75 %	0 %	0 %	25 %	347533759
129	NC_015978	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533759
130	NC_015978	AATT	2	8	7432	7439	50 %	50 %	0 %	0 %	347533759
131	NC_015978	ATG	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
132	NC_015978	TCG	2	6	7538	7543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533759
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134	NC_015978	AAT	2	6	7569	7574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533759
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